非企业法人在我国高校、科研院所等领域广泛存在。中央级农业科研单位为加快自身发展举办非企业法人单位,取得了明显成效。由于这类法人单位的管理没有完备的制度体系作为依据,财务管理方面问题较多。文章从制度层面梳理了该类法人单位在财务管理方面存在的问题,从完善法人治理结构、强化监督管理、加强内部控制、明细财务管理模式等方面提出了加强管理的建议,为该类法人单位加强财务管理提供了借鉴和参考。