基于肿瘤基因组图谱分析肾透明细胞癌浸润性免疫细胞分布及预后

作者：王俊; 邱建新^*

来源：世界临床药物, 2019, 40(06): 402-408.

DOI：10.13683/j.wph.2019.06.005

• 肾透明细胞癌
• 肿瘤浸润免疫细胞
• 预后

目的了解肾透明细胞癌不同分子亚型中浸润性免疫细胞的分布特点,探讨肾透明细胞癌分子亚型与肿瘤预后的关系。方法采用生物信息学方法,对肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中肾透明细胞癌样本基因表达定量数据进行分析,对获得的肾透明细胞癌分子亚型,应用CIBERSORT软件计算每个肿瘤样本中22种免疫细胞的分布比例,Cox回归模型评估不同肾透明细胞癌分子亚型与总生存期(OS)的关系。结果验证肾透明细胞癌存在3种亚型。533例肾透明细胞癌肿瘤组织中,M2巨噬细胞(28.33%)、未活化CD4+记忆性T胞(18.05%)、CD8 T细胞(10.05%)、M1巨噬细胞(6.91%)、单核细胞(4.14%)、未活化的肥大细胞(3.86%)、调节性T细胞(3.01%)、滤泡辅助性T细胞(2.83%)及未活化的自然杀伤细胞(2.67%)分布较为丰富。肾透明细胞癌亚型2(4.26%)与亚型3(3.97%)中的调节性T细胞分布比例均显著高于亚型1(1.92%);亚型2(5.79%)与亚型3(5.88%)中的M1巨噬细胞分布比例显著低于亚型1(8.16%);亚型1中的未活化肥大细胞分布比例(5.48%)显著高于亚型2(2.48%)与亚型3(3.45%),以上差异均有统计学意义(均P <0.001)。Kaplan-Meier生存曲线及COX回归分析均发现亚型1组患者总生存期相对较长,且预后相对较好;亚型2组患者总生存期最短,且预后也较差;亚型3组患者总生存期介于亚型1组与亚型2组之间。结论不同肾透明细胞癌分子亚型中,浸润性免疫细胞分布比例差异显著,肾透明细胞癌分子分型与患者预后明显相关。

• 单位
  上海交通大学