绒山羊胚胎期次级毛囊发生发育相关miRNA的筛选及靶基因验证

作者：尚方正; 马荣; 戎友俊; 潘剑锋; 王敏; 牛舒冉; 齐云鹏; 李彦伯; 李金泉^*; 张燕军^*

来源：中国农业大学学报, 2023, 28(02): 90-103.

• 绒山羊
• 次级毛囊
• miRNA
• 靶基因

为筛选绒山羊次级毛囊发生发育相关microRNA(miRNA)及靶基因验证，本研究基于课题组前期高通量测序技术得到绒山羊胎儿期(45、55、65、75、95、115和135 d)皮肤组织miRNA表达谱的基础上，鉴定各比对组中差异表达的miRNA并根据毛囊形态发生规律筛选次级毛囊发生发育相关的miRNA,运用RNAhybrid、miRanda和TargetScan软件预测筛选到的miRNA靶基因并与次级毛囊发育相关基因取交集，所得基因进行GO和KEGG富集分析，筛选毛囊发生发育重要通路中的关键基因构建miRNA-mRNA调控网络，进而运用双荧光素酶报告验证关键miRNA-mRNA的靶向关系。结果表明：1)筛选到次级毛囊发生发育相关miRNA 153个，共预测到32 978个靶基因；2)取交集后得到1 352个靶向的次级毛囊发生发育相关的基因，且显著富集在29条KEGG通路中，其中毛囊发生发育重要通路TGF-β同样显著富集；3)构建了chi-miR-26b-5p-SMAD1和chi-miR-495-3p-SMAD1等232对次级毛囊发生发育可能相关的miRNA-mRNA关系对，双荧光素酶报告系统进一步验证了关键靶向关系。本研究为解析miRNA在绒山羊次级毛囊发育过程中的分子机制奠定了前期基础。

• 单位
  动物科学学院; 内蒙古农业大学