基于EST-SSR标记的野生榧树居群遗传多样性分析

作者：陈焘; 李杰峰; 张迟^*; 高樟贵; 金航标; 戴文圣; 唐海英; 张敏^*

来源：安徽农业大学学报, 2020, 47(02): 224-231.

DOI：10.13610/j.cnki.1672-352x.20200518.022

• EST-SSR
• 榧树
• 遗传多样性
• 遗传结构

对野生榧树居群进行遗传多样性分析,有利于榧树野生资源的开发和利用。利用基于榧树(Torreya grandis)种仁转录组开发的36对多态性EST-SSR引物,对5个野生榧树居群共142个单株的遗传多样性进行分析。通过聚类分析、STRUCTURER遗传结构分析、分子方差分析(AMOVA)和主坐标分析(PCoA)等方法分析居群遗传结构。结果表明,5个居群的平均等位基因数(Na)为4.285 7～6.638 9,Shannon’s指数(I)为1.015 0～1.373 6,Nei’s遗传多样性指数(H)为0.532 7～0.656 1。36个SSR位点的平均遗传分化指数Fst为0.261 9,平均近交系数Fis为0.398 1,平均基因流(Nm)为0.704 7。居群成对分析显示,除黄山-嵊州居群间以及嵊州-松阳居群间,其他居群间Fst均大于0.15,基因流大于1。分子方差分析表明5个榧树居群的遗传差异主要存在于居群内(72%)。居群的遗传结构分析显示,黎川与松阳居群的遗传结构比较相似,而诸暨居群、嵊州居群及黄山居群等3个居群的遗传结构差异较大。5个野生榧树居群具有较高的遗传多样性,居群遗传结构的分析结果与各居群的地理分布基本一致。

• 单位
  浙江农林大学