2019年1月1日起我国新政府会计制度全面正式实施,新会计制度对高校的会计核算、预算管理、资产负债管理等业务活动层面的内部控制都提出了更高的要求。本文就政府会计制度对高校内部控制的影响进行了探讨,分析了内控方面的不足,并提出合理化建议,从而更好的适应制度改革,提升高校财务管理和内部治理水平。