山羊SAMD12基因分子及表达特征分析

作者：吕锦诗; 李安; 刘珂含; 王永^*; 李艳艳; 王友利; 刘伟; 林亚秋

来源：西南民族大学学报(自然科学版), 2023, 49(02): 134-141.

• 山羊
• SAMD12基因
• 生物学特性
• 表达特征

旨在克隆山羊SAMD12基因，明确SAMD12分子特征及表达特征，探究SAMD12基因对山羊肌内脂肪细胞分化的影响.首先通过RT-PCR技术扩增获得山羊SAMD12基因序列，利用生物信息学分析软件及qPCR技术明确山羊SAMD12分子特征及其在山羊组织、肌内脂肪细胞分化过程中的表达模式.结果表明，扩增获得山羊SAMD12基因序列734 bp, CDS区486 bp,编码氨基酸161个.山羊SAMD12特征分析结果显示SAMD12蛋白带正电且属于碱性亲水不稳定蛋白，主要分布于细胞核(52.2%),含有SAM家族所特有的SAM功能结构域.SAMD12蛋白二级结构中大部分氨基酸以α-螺旋、无规卷曲的方式存在.同源性比对结果显示山羊SAMD12与绵羊SAMD12同源性高达90.7%,同源性最低的为马(23.4%).系统进化树结果显示：山羊与绵羊、家牛划分为一支，说明山羊SAMD12与这两种哺乳动物亲缘关系最近.组织表达特征分析显示：SAMD12在山羊多个组织中均有表达，在瘤胃中表达量最高，其次为肾，这两种组织中的表达量都显著高于其他组织(P<0.05).细胞时序表达特征谱分析显示：成脂诱导分化后山羊SAMD12基因整体表达水平呈上升趋势，在诱导分化96 h时表达量达到最高值，显著高于0 h(P<0.05).以上结果提示，SAMD12基因在山羊肌内脂肪细胞成脂过程中可能起重要作用.

• 单位
  西南民族大学