基因表达谱整合分析揭示胰腺导管腺癌相关特异信号转导途径

作者：Jun Li; Wenle Tan; Linna Peng; Jialiang Zhang; Xudong Huang; Qionghua Cui; Jian Zheng; Wen Tan; Chen Wu; Dongxin Lin^*

来源：癌症, 2018, 37(11): 511-522.

• 胰腺癌
• GEO
• 途径网络
• CKS2

背景与目的因为常规癌症治疗对胰腺导管腺癌(pancreatic duct adenocarcinoma,PDAC)而言疗效不佳,所以胰腺癌严重威胁着人类的健康。微阵列研究报道许多与胰腺癌相关基因,但是并未对微阵列数据进行深入整合分析。本研究利用与胰腺癌相关的6个微阵列基因表达谱来探讨与PDAC相关的基因和信号转导途径。方法采用信号通路网络方法分析6个已经发表的胰腺癌基因表达谱数据(GSE71989、GSE15471、GSE16515、GSE32676、GSE41368和GSE28735)。根据癌症基因组图谱和国际癌症基因组联合会数据库中的数据来评估PDAC相关基因的表达对胰腺癌患者存活时间的潜在影响,在我们医院收集的102例PDAC患者中检测到了一种候选基因(CKS2)的表达,其与患者存活相关。在PDAC细胞系BxPC-3和CFPAC-1中检测CKS2敲低后的影响。结果称为"癌症途径"的KEGG信号途径可能在胰腺癌的发生和发展中有重要作用。该途径中的5个基因(BIRC5、CKS2、ITGA3、ITGA6和RALA)与PDAC患者的生存时间显著相关。CKS2在我们医院PDAC样本中过表达,这些患者CKS2的高表达与较短的生存时间相关。体外敲低CKS2能够抑制PDAC细胞的增殖。结论整合目前微阵列数据集的分析可以确定"癌症通路"是PDAC的一个重要信号途径。这种整合方法可能对鉴别癌症相关基因和途径非常有效。

• 单位
  中山大学肿瘤防治中心; 华南肿瘤学国家重点实验室; 南京医科大学; 中国医学科学院; 北京协和医学院