澳洲坚果MiSTPP5基因在不同组织及低温胁迫的表达分析

作者:蔡元保; 杨祥燕*; 黄强; 曾黎明; 李冰; 潘如军
来源:基因组学与应用生物学, 2022, 41(03): 617-624.
DOI:10.13417/j.gab.041.000617

摘要

丝氨酸/苏氨酸磷酸酶PP1家族在植物生长发育和响应逆境胁迫中发挥重要的作用。探索澳洲坚果MiSTPP5基因在不同组织中和低温胁迫下的表达规律,可为深入研究PP1家族成员在澳洲坚果生长发育和抗寒分子机制提供理论基础。本研究采用RT-PCR技术克隆澳洲坚果MiSTPP5基因,利用生物信息学分析其编码蛋白,并通过实时荧光定量PCR检测其在澳洲坚果不同组织中及低温胁迫下的表达模式。结果显示,澳洲坚果MiSTPP5含有PP1家族的典型结构域MPP_PP1_PPKL,属于稳定的亲水性蛋白和非分泌跨膜蛋白。MiSTPP5蛋白以丝氨酸残基磷酸化为主,定位于细胞质的可能性最大(高达65%),其二级和三级结构主要以α螺旋、无规则卷曲和延伸链交错而成。MiSTPP5基因在澳洲坚果的根、茎、叶、花和小果等器官组织中都有表达,其中在叶片中的表达量最高,在根中则最低。在低温胁迫下,MiSTPP5基因在叶片中的表达量呈现“升-降-升-降”的表达模式,总体上受诱导上调表达。因此,澳洲坚果MiSTPP5基因在不同组织中都有表达,并受低温胁迫诱导上调表达。

全文