RNA干扰MDCht9基因的家蝇幼虫的转录组分析

作者：李妍; 国果^*; 苏佩佩; 赵欣宇; 杨隆兵; 赵文静; 修江帆

来源：基因组学与应用生物学, 2021, 40(02): 569-577.

DOI：10.13417/j.gab.040.000569

• MDCht9
• RNA干扰
• 转录组

家蝇(Musca domestica)属于双翅目昆虫,广泛分布于世界各地,目前家蝇抗药现象较为严重。为了筛选及挖掘与防治有害医学昆虫相关的分子靶标,本研究以家蝇幼虫为实验对象,采用RNAi方法沉默家蝇几丁质酶MDCht9基因后,分析幼虫mRNA转录组表达变化,初步探讨MDCht9的功能。研究结果表明,在注射dsRNA 24 h后,幼虫MDCht9 mRNA的表达显著下降85%,提示干扰有一定效果。实验组与对照组相比共筛选出378个基因差异表达显著,其中上调基因162个,下调基因216个,占所有被检测到转录RNA基因的百分比为2.66%。通过GO和KEGG相关生物信息学分析,挖掘出涉及幼虫时期生长发育、蛋白质的消化与吸收、雄虫性成熟、物质代谢等相关通路基因。采用实时荧光定量PCR对差异基因进行验证,与转录组结果一致。本实验通过RNAi方法成功降低MDCht9基因mRNA表达,MDCht9基因参与幼虫时期生长发育、蛋白质的消化与吸收、雄虫性成熟、物质代谢等功能。本研究结果有助于后续生物信息学分析及为家蝇生长发育关键基因的挖掘提供基础数据,为害虫防治提供新的靶标途径。

• 单位
  基础医学院; 贵州医科大学