水稻Osa-miR5485生物信息学分析及表达载体构建

作者：李亚娟; 陈冠明; 刘鸿森; 朱华霞; 陈志雄^*

来源：分子植物育种, 2021, 19(15): 4994-5001.

DOI：10.13271/j.mpb.019.004994

• 水稻
• microRNAs
• 幼穗
• 非生物胁迫

为研究水稻microRNAs (miRNAs)的功能,本研究采用生物信息学方法分析Osa-miR5485的结构及功能注释。结果表明,Osa-miR5485前体序列具有典型的发夹结构,其启动子具有41个顺式作用元件,其中有些作用元件与非生物胁迫、激素、组织特异性表达相关。实时荧光定量PCR (RT-qPCR)分析结果发现,Osa-miR5485在幼穗具有特异性表达。利用psRNATarget和Starbase数据库预测到Osa-miR5485调控的73个靶基因。GO功能注释结果表明,靶基因主要涉及水解酶活性和碳水化合物的结合等分子功能、膜和质膜等细胞组分、胁迫应答和DNA修复等生物过程。多个Osa-miR5485靶基因表达呈现器官或组织特异性,或受干旱、ABA、JA等非生物胁迫诱导表达。RT-qPCR分析发现,Osa-miR5485表达模式与靶基因LOCOs11g38260 (编码质体原纤蛋白)呈现相反的趋势,初步推测Osa-miR5485参与水稻生殖生长阶段的非生物胁迫反应。构建了Osa-miR5485的增强表达载体和基因编辑载体,为进一步探讨Osa-miR5485的生物学功能奠定基础。

• 单位
  华南农业大学