基于高通量测序技术的新疆传统干奶酪乳酸菌多样性分析

作者：赵顺先; 关统伟^*; 向慧平; 张国栋; 张习超; 欧梦莹; 林宜锦; 王鹏昊

来源：四川农业大学学报, 2018, 36(05): 688-695.

DOI：10.16036/j.issn.1000-2650.2018.05.017

• 高通量测序
• 乳酸菌
• 干奶酪
• 多样性

【目的】探究新疆传统干奶酪中乳酸菌的多样性。【方法】采用lllumina高通量测序技术测定12份干奶酪中乳酸菌16S rDNAV4变异区序列,使用Qiime、Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元数量(operational taxonomic units,OTUs),分析物种的丰度、分布和Alpha多样性。【结果】12份干奶酪中乳酸菌归为2个目7个科12个属。其中乳杆菌属(Lactobacillus)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)、魏斯氏菌属(Weissella)和片球菌属(Pediococcus)是优势菌属,占所测得乳酸菌类群的(98.65±1.52)%。在种水平上鉴定到9种优势乳酸菌种,其中短双歧杆菌(Bifidobacterium breve)和类肠膜魏斯氏菌(Weissella paramesenteroides)中丰度最高。采用环境因子关联性分析发现多种因素共同影响着新疆干奶酪乳酸菌多样性。【结论】新疆干奶酪中存在着丰富的乳酸菌多样性,其菌群组成与干奶酪的组成成分有关。

• 单位
  西华大学