摘要

通过对NCBI数据库里的罗湖病毒(tilapia lake virus, TiLV)核苷酸序列进行生物信息学分析,了解罗湖病毒在全球的流行情况和中国罗非鱼(tilapia)养殖中罗湖病毒的感染情况。该研究将第3个片段的序列比对结果中的罗湖病毒分成12个簇群,通过对片段进行motif序列富集,显示motif序列每个位点的碱基。对从广东各地区罗非鱼养殖场采集到的302份样本进行检测,结果显示,均未检测出罗湖病毒阳性,并且显示motif序列位点的碱基非常稳定。通过对罗湖病毒进行分子流行病学分析,中国虽未有罗湖病毒流行的趋势,但在进出口贸易中仍要严格防控罗湖病毒的输入,并应对这些非常保守的motif的相关功能进行深入研究。