基于生物信息学挖掘原发性肝癌中新的生物标志物

作者：景芸钏; 罗涛; 罗杰; 周圆^*

来源：生物技术, 2021, 31(06): 553-545.

DOI：10.16519/j.cnki.1004-311x.2021.06.0085

• 生物信息学
• 原发性肝癌
• 预后生物标志物
• KPNA2
• RRM2

[目的]利用生物信息学挖掘原发性肝癌中新的生物标志物。[方法]分析ONCOMINE数据库中197例中国原发性肝癌患者和76例正常样本中的差异表达基因。利用生物信息学手段筛选得到生物标志物，并验证其在临床样本中的表达。采用TCGA和R软件构建预后模型；通过STRING和DAVID数据库分析其共表达基因和生物功能。最后，利用GEPIA 2.0和TIMER 2.0数据库分析其与肿瘤免疫浸润的关系。[结果]筛选得到的前42个差异表达基因(P<1.69 E-89)中，Hub基因KPNA2和RRM2的过表达会造成原发性肝癌患者的生存预后不良，但RRM2不符合多因素Cox模型。C-index:0.803(0.746-1)可预测原发性肝癌患者1、3、5年生存预后率(P<0.01)。二者可调控多条通路且与肿瘤免疫浸润显著相关(P<0.01)。[结论]过表达的KPNA2能通过调控RNA的转运、谷胱甘肽的代谢和p53通路降低患者生存预后率且符合Cox模型(P<0.01),是一种新的原发性肝癌生物标志物。C-index:0.803(0.746-1)可为临床预测患者1、3、5年生存预后率提供参考(P<0.01)。有研究已验证KPNA2在原发性肝癌中的表达，这侧面证实了此结论的准确性。

• 单位
  湖北医药学院; 湖北省十堰市太和医院