摘要
基于中药分子机理的生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)研究长春花治疗癌症的分子机制。应用BATMAN-TCM平台,预测长春花的潜在作用靶点,使用GeneCards数据库检索癌症靶点。然后利用Cytoscape 3.7.0软件构建化合物-疾病-靶点相互作用网络。针对长春花的抗癌靶点,进行了基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,以确定长春花抗癌的基因功能。最后,从长春花中筛选出9种活性成分,构建了化合物-疾病-靶点网络。基于STRING建立的长春花靶点的PPI网络包括55个节点和328个相互作用关系。关键节点包括CTNNB1、JUN、VEGFA、ESR1、HIF1A、FOS、MTOR。此外,GO富集分析共确定了73个通路,包括RNA聚合酶II特异性DNA结合转录因子结合、DNA结合转录因素结合、泛素蛋白连接酶结合、泛蛋白样蛋白连接酶类结合。此外,在KEGG通路富集分析中,获得了106条信号通路,其中PI3K-Akt信号通路和HIF-1信号通路是与癌症相关的关键通路。本研究发现长春花通过多组分-多靶点-多途径的协同调控实现了抗癌作用,为长春花的应用提供了理论依据和科学依据。
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单位河北医科大学第一医院; 河北医科大学第二医院