甜橙PEBP基因家族的鉴定及在成花过程的表达分析

作者：杨杰; 贺新兴; 陈蓉; 胡乐贞; 佟晓楠; 李兴涛

来源：分子植物育种, 2020, 1-12.

• 甜橙
• PEBP基因家族
• 基因结构
• 进化关系
• 表达

磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine-binding protein， PEBP)基因家族的氨基酸结构中有保守的磷脂酰乙醇胺结合蛋白结构域，对控制植物花器发育和开花时间具有重要作用。本试验旨在研究CsPEBP基因家族对甜橙花期诱导的调控模式，利用PEBP蛋白特征结构域PBP的隐马尔可夫模型在甜橙基因组中进行HMMER分析，鉴定出7个CsPEBP基因，并对CsPEBPs编码蛋白的理化性质、蛋白基序、进化关系、顺式调控元件和表达谱等方面进行研究。结果表明CsPEBPs分布在甜橙5条染色体上。遗传进化树聚类成4个亚族，CsPEBP基因家族成员被分在TFL1-subclade、MFT-subclade、FT-subclade 3个亚族中。7个CsPEBP基因均含有光响应元件，表明CsPEBPs受光诱导调控。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析发现，CsPEBP基因在两个甜橙品种芽和叶的表达模式不同，其中CsFT1和CsFT2在两甜橙品种花芽和叶片中的相对表达量均有显著上调的趋势，而CsTFL1a、CsTFL1b和CsTFL1c在它们花芽和叶片中的相对表达量均显著下调；另外，早熟品种赣南早开花时期，赣南早花芽和叶片中CsFT亚族基因的表达量高于晚熟品种纽荷尔，而CsTFL1亚族基因是相反的，说明花芽细胞内CsFTs高表达和CsTFL1s低表达导致了甜橙花期提前，CsPEBPs对调控甜橙开花时间起重要作用。本研究获取了甜橙PEBP基因家族成员的序列和部分功能信息，为进一步分析CsPEBP基因家族在甜橙成花转变中的功能提供参考。

• 单位
  国家脐橙工程技术研究中心; 生命科学学院; 赣南师范大学