南京市食源性致泻大肠埃希氏菌多位点序列分型及耐药基因分析

作者：王燕; 江晓; 叶艳华; 王璇; 董潇潇; 许文炯; 雍玮; 杜雪飞; 丁洁^*

来源：现代预防医学, 2020, 47(15): 2810-2823.

• 大肠埃希氏菌
• 多位点序列分型
• 序列型
• 耐药基因

目的对南京地区食源性疾病监测中致泻性大肠埃希氏菌(diarrheagenic Escherichia coli,DEC)分离株进行多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST),了解超广谱β-内酰胺酶(Extended-spectrum beta-lactamases, ESBLs)耐药基因blaTEM、blaCTX-M和质粒介导的喹诺酮耐药基因(plasmid-mediated quinolone resistance,PMQR)qnrA、qnrB、qnrS、oqxA、oqxB、qepA、aac(6’)-Ib-cr的流行情况及其与MLST型别之间的关联。方法对食源性监测中60株DEC分离株的管家基因(adk、fumC、gyrB、icd、mdh、purA、recA)进行PCR扩增和测序,用EnteroBase上下载的ST(Sequencetype)分型方案确定菌株序列型。PCR法检测超广谱β-内酰胺酶ESBLs耐药基因和质粒介导的喹诺酮耐药基因PMQR。结果60株DEC可分为34个ST型别,其中ST48为优势型别(16.67%),发现两个新等位基因型,fumC1413和purA746,一个新序列型ST9953。共有43株(71.67%)携带ESBLs耐药基因,10株(16.67%)携带喹诺酮耐药基因PMQR。ESBLs阳性的大肠埃希氏菌株中占比最高的是ST10组群。结论南京地区食源性疾病监测中致泻性大肠埃希氏菌最常见的序列型是ST48。特定的ST型别在DEC不同类型中的分布不同,两者之间呈现一定相关性。ESBLs广泛流行,blaTEM为主要流行基因,最流行的PMQR基因是qnrS。

• 单位
  南京市疾病预防控制中心