基于网络药理学及分子对接探讨丁香-柿蒂治疗食管癌的分子机制

作者：方崇锴; 骆嘉俊; 傅诗韵; 聂多锐; 张涛; 黄瑞麟; 黄学武; 肖志伟^*

来源：中药新药与临床药理, 2020, 31(03): 315-323.

DOI：10.19378/j.issn.1003-9783.2020.03.011

• 丁香
• 柿蒂
• 食管癌
• 网络药理学
• 分子对接

目的预测丁香-柿蒂药对治疗食管癌的作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选出丁香、柿蒂的活性成分;在PubChem数据库中搜索活性成分的化学分子式,将化学分子式上传至靶点预测数据库(SwissTargetPrediction)得到预测的基因靶点。以"esophageal cancer"为关键词,在基因疾病关联数据库(DisGeNET)中检索食管癌的相关靶基因,将其与药对的活性成分靶基因相互映射,筛选出共同靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件绘制活性成分-靶点网络。将筛选出来的靶点在蛋白质相互作用网络数据库(STRING)中构建蛋白互作网络;同时,选择生物信息分析学习平台(Omicshare)进行基因GO功能及KEGG通路的富集分析。使用分子对接软件(AutoDock Vina),将核心靶点与活性成分进行分子对接,并使用分子绘图软件(PyMol)和(LigPlus)绘制图片。结果从丁香-柿蒂药对中共筛选出11个活性成分,包括槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、齐墩果酸(oleanolic acid)等,主要作用于AKT1、SRC、EGFR 3个靶点,主要涉及FoxO、Relaxin、PI3K-AKT、Rap1等信号通路。结论本研究通过网络药理学的方法预测丁香-柿蒂药对治疗食管癌的分子机制,为丁香-柿蒂药对治疗食管癌的基础研究和临床应用提供参考。

• 单位
  广州中医药大学; 广州中医药大学第一附属医院; 第一临床医学院