摘要
目的评估囊泡胺转运蛋白1(VAT1)在皮肤黑素瘤(SKCM)中的免疫浸润景观和预后价值。方法采用基因表达谱交互分析(GEPIA)方法分析VAT1在SKCM中的mRNA表达,利用人类蛋白图谱(HPA)进行蛋白质水平的验证。通过GEPIA的生存模块评估VAT1对SKCM患者生存的影响,并利用GSE98394数据集进行验证。从TCGA下载SKCM的数据集,采用单因素Cox分析评估VAT1与生存率的关系,利用GSE98394数据集进行验证。利用肿瘤免疫评估资源(TIMER)检测SKCM中免疫浸润水平与VAT1表达以及SKCM累积存活率的相关性。使用CIBERSORT的相关模块进一步探讨VAT1与肿瘤免疫浸润的相关性。结果在SKCM中,VAT1的mRNA和蛋白质表达水平较正常人高。生存曲线和单因素Cox分析显示VAT1表达上调是预后不良的因素。VAT1的表达水平与SKCM中CD8+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞的浸润水平呈负相关(P均+T细胞、活化的记忆CD4+T细胞、M1巨噬细胞、驻留肥大细胞、调节性T细胞、活化的NK细胞、浆细胞等免疫细胞组成比例上差异均有统计学意义(P均<0.05)。结论VAT1是SKCM潜在的预后生物标志物,且与免疫浸润有关。
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单位第一临床医学院; 南方医科大学皮肤病医院; 南方医科大学