基于叶绿体片段序列的苹果属植物遗传多样性

作者：高源; 王大江; 王昆^*; 李连文; 朴继成

来源：华北农学报, 2020, 35(06): 42-51.

• 苹果属
• 叶绿体基因
• 居群
• 遗传多样性
• 遗传变异

从叶绿体基因水平上研究中国原产苹果属植物的遗传多样性以及不同种在不同区域范围的单倍型的系统进化关系,为其起源演化、保护和利用提供依据。基于叶绿体基因间区trnH-psbA、trnS-trnG spacer+intron、trnT-5′trnL和5′trnL-trnF,对来源于12个省区的722份苹果属植物种质进行序列分析,4个区域合并之后片段长度为4 120 bp,共有579个多态性变异位点和100个单倍型,核苷酸多样性(Pi)和单倍型多样性(Hd)分别为0.009 52和0.879,两者最高的区域为trnH-psbA(Hd=0.808,Pi=0.034 09)。Tajima′s D检验中,4个cpDNA区域合并后的Tajima′s D值为-1.503 16,在P>0.10检测水平上不显著,遵循中性模型。AMOVA分析表明,遗传变异主要存在于种群间和种内居群内。单倍型分布及网络结构分析结果表明,邻接网络中心位置的缺失单倍型闭合成环,苹果属不同种具有不同的演化路线,各个种间以及同种种质在不同地域起源演化过程中具有错综复杂的关系,相对古老的单倍型H6和H15经历种群扩张,衍生支系较多。苹果属植物叶绿体基因的遗传多样性水平较高,其遗传变异主要发生在种群间和各种居群内,其遗传进化以种群内突变或者随机漂变为主,种内差异和地理隔离造成的各种居群内差异是苹果属植物遗传变异的主要因素。

• 单位
  中国农业科学院果树研究所