金钱鱼Sox3基因cDNA克隆及组织表达

作者：李智渊; 洪广; 王耀嵘; 李广丽; 朱春华; 陈华谱; 田昌绪

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(07): 2980-2988.

DOI：10.13417/j.gab.039.002980

• 金钱鱼
• Sox3基因
• 克隆
• 序列分析
• 组织分布

金钱鱼是中国重要经济型鱼类,但其人工繁殖难以取得成功。本研究利用cDNA末端快速扩增法(rapid-amplification of cDNA ends, RACE)克隆了金钱鱼(Scatophagus argus) Sox3基因cDNA全长序列,分析该基因序列在不同物种间的差异,并用RT-PCR半定量方法分析其在雌、雄组织中的表达差异。结果表明:金钱鱼Sox3 c DNA全长1 270 bp,包括5'非翻译区(5'-UTR) 217 bp、3'非翻译区(3'-UTR) 150 bp和开放阅读框(open reading frame, ORF) 903 bp,编码300个氨基酸,该氨基酸序列34～104位为HMG保守盒。金钱鱼Sox3氨基酸序列与大黄鱼(Larimichthys crocea)的同源性最高,为99.3%,其次是金头鲷(Sparus aurata),为98.7%。Sox3前体蛋白的系统进化树显示,金钱鱼与大黄鱼亲缘关系最近。金钱鱼Sox3基因的组织表达有明显的组织特异性及性别差异,在性腺中表达量最高,雄性个体脑和垂体次之,肌肉、肾脏、心脏和肠有低量的表达,肝脏、脾脏、胃和鳃中未检测到表达;雌性个体在卵巢中观察到表达水平最高,脑、垂体和鳃次之,脾脏、肌肉、肾脏、心脏和肠中有低量的表达,肝脏和胃中未检测到表达。本研究为研究Sox3基因在金钱鱼人工繁殖与养殖产业方面提供理论参考。

• 单位
  广东海洋大学