沙柳SpsLAS2和SpsLAS3基因克隆与生物信息学及组织特异性表达分析

作者：王雷; 刘畅; 袁梦如; 贺玉娇; 金娜; 杨海峰^*

来源：北方园艺, 2019, (10): 57-66.

• 沙柳
• SpsLAS2
• SpsLAS3
• 基因克隆
• 序列分析

为促进沙柳(Salix psammophila)的分子定向育种,研究其分枝调控遗传机制,以沙柳为试验材料,采用同源克隆技术克隆获得沙柳SpsLAS2、SpsLAS3基因并做生物信息学及组织特异性表达分析。结果表明:SpsLAS2和SpsLAS3基因序列相似性达96.7%,氨基酸序列相似性达97.6%。SpsLAS2和SpsLAS3基因ORF长分别为1 248、1 254 bp,分别编码415 aa和417 aa。其氨基酸序列具有GRAS(Gibberellin-Insensitive,Repressor of ga1-3,Scarecrow)基因家族典型的5个结构域[1],属LS亚家族。qRT-PCR组织特异性分析发现2个基因均在叶腋处表达量最高,表明2个基因在叶腋中是特异表达的,可能调节叶腋分生组织的发育形成。SpsLAS2、SpsLAS3相似度较高,但也存在一定差异,推测2个基因可能是同一染色体的串联基因倍增关系。

• 单位
  内蒙古农业大学