我国高校院(系)层面内部治理结构基本合理,但巡察发现仍存在党委权实不符、党政职能界定模糊、民主决策制度不健全、学术权力弱化等问题。高校应调整院(系)党委、行政和学术三种权力配置,集中从制度层面和治理文化氛围养成角度,切实有效地调动包括广大一线师生员工的参与积极性,推动全面深化高等教育综合改革的持续深入。