1株H6N6亚型禽流感病毒分子遗传特性分析

作者：祁思敏; 宋勇春; 崔仑标; 焦永军; 祁贤

来源：微生物与感染, 2017, 12(05): 287-293.

• 禽流感病毒
• H6N6亚型
• 病毒分离
• 基因组测序

本研究采用无特定病原体（specific pathogen free,SPF）鸡胚,从某活禽市场环境中分离出1株H6N6亚型禽流感病毒（A/environment/Zhenjiang/zj18/2013,en/zj18）。通过二代测序技术进行全基因组测序,通过BLASTn进行同源性检索,并采用MEGA5.0软件构建系统发生树。基因进化树分析表明,分离株en/zj18的所有8个基因节段（PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M和NS）均与近年来中国华东地区流行的H6N6亚型禽流感病毒的相应基因位于同一进化分支,与参考株的核苷酸同源性达96.7%99.6%。分离株en/zj18的HA蛋白裂解位点为PQIETR↓GL,是低致病性禽流感病毒的分子特征。HA蛋白上关键受体结合位点190和228位（按H3亚型的HA蛋白序列排序）氨基酸分别是E和G,理论上更易与α2,3-半乳糖苷唾液酸受体结合。结果提示,需加强活禽市场禽流感病毒的持续监测,从而为有效应对禽流感病毒对公共卫生的持续威胁提供科学依据。

• 单位
  南京大学; 浙江省中医药大学; 生命科学学院; 江苏省疾病预防控制中心