大鲵血源抗菌肽AndricinB的生物信息学分析

作者：任婷; 王金泽; 郑天骄; 王蓓蓓; 王梦姣^*; 裴金金^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2021, (22): 123-154.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.01.0209

• 大鲵
• 抗菌肽
• AndricinB
• 生物信息学分析
• 二级结构

为研究从大鲵血液中分离鉴定得到的抗菌肽AndricinB的生物学功能,本研究根据已获得的大鲵血源抗菌肽AndricinB氨基酸序列分析其氨基酸组成,采用生物信息学分析工具(软件)分析其理化性质、二级结构、3D构象、信号肽及跨膜区和酶切位点。结果表明:大鲵血源抗菌肽AndricinB含有10个氨基酸残基,分子式为C53H92N14O13;分子质量为1 133.4 u;理论等电点为11;10个氨基酸残基中,正电荷氨基酸数目为2个,无负电荷氨基酸;在体外哺乳动物网状细胞中半衰期为30 h,在酵母体内的半衰期>20 h,在大肠杆菌体内的半衰期>10 h;不稳定指数为0.51;脂溶性指数为146.0;亲水性平均系数为0.880;二级结构中,无规则卷曲占比为100%;3D构象的能量为-208.339 465 kJ/mol,梯度为0.093 777;无跨膜区和信号肽;可被多种蛋白酶剪切。说明大鲵血源抗菌肽AndricinB为天然小分子、阳离子型、无规则结构的抗菌肽,虽不利于生物表达与开发应用,但易被体内多种蛋白酶酶解,具有良好的安全性。

• 单位
  陕西理工大学