安庆市人与猪群中戊型肝炎病毒的系统进化分析

作者：夏玉刚; 胡安群; 陆一涵; 刘海燕; 郑英杰

来源：中华预防医学杂志, 2010, (10): 888-892.

• 肝炎病毒,戊型
• 基因型
• 进化
• 序列分析

目的了解安庆市人与猪群中流行的戊型肝炎病毒(hepatitis E Virus,HEV)的基因型和系统进化特征。方法收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,并根据采样时间将猪胆汁标本分为A、B、C、D等4组(每组各100份)。应用巢氏逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测HEV开放式阅读框架(openreading frame,ORF)2区域内150 nt序列,测序后与GenBank下载的参考病毒株序列进行比对,并计算核苷酸序列间的同源性。使用贝叶斯推断法构建系统进化树,分析安庆市人与猪群中HEV的基因型和系统进化关系。结果患者的男女性别比例为2.86:1,平均年龄为56.78岁。27份患者血清标本中有16份检出HEV RNA,阳性检出率为59.26%。安庆市人HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为74.75%～82.99%、75.26%～83.64%、72.77%～80.57%和88.03%～91.63%。400份猪胆汁中有22份(5.5%)分离出HEV RNA,A、B、C、D各组的HEV携带率分别为7.00%、3.00%、9.00%、3.00%,各组间的猪HEV携带率差异无统计学意义(x~2=5.20,P=0.16)。安庆市猪HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为75.24%～83.42%、75.93%～84.19%、72.86%～80.64%和88.15%～91.79%。系统进化树分析结果显示,安庆市人和猪HEV病毒株均属于基因Ⅳ型,且错落分布于进化分支上,无明显的物种聚集现象。结论基因Ⅳ型HEV为安庆市人和猪的优势病毒株,且有可能在该地区人和猪群中跨物种传播。

• 单位
  安庆市立医院; 公共卫生学院; 公共卫生安全教育部重点实验室; 复旦大学