摘要
目的了解安庆市人与猪群中流行的戊型肝炎病毒(hepatitis E Virus,HEV)的基因型和系统进化特征。方法收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,并根据采样时间将猪胆汁标本分为A、B、C、D等4组(每组各100份)。应用巢氏逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测HEV开放式阅读框架(openreading frame,ORF)2区域内150 nt序列,测序后与GenBank下载的参考病毒株序列进行比对,并计算核苷酸序列间的同源性。使用贝叶斯推断法构建系统进化树,分析安庆市人与猪群中HEV的基因型和系统进化关系。结果患者的男女性别比例为2.86:1,平均年龄为56.78岁。27份患者血清标本中有16份检出HEV RNA,阳性检出率为59.26%。安庆市人HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为74.75%~82.99%、75.26%~83.64%、72.77%~80.57%和88.03%~91.63%。400份猪胆汁中有22份(5.5%)分离出HEV RNA,A、B、C、D各组的HEV携带率分别为7.00%、3.00%、9.00%、3.00%,各组间的猪HEV携带率差异无统计学意义(x~2=5.20,P=0.16)。安庆市猪HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为75.24%~83.42%、75.93%~84.19%、72.86%~80.64%和88.15%~91.79%。系统进化树分析结果显示,安庆市人和猪HEV病毒株均属于基因Ⅳ型,且错落分布于进化分支上,无明显的物种聚集现象。结论基因Ⅳ型HEV为安庆市人和猪的优势病毒株,且有可能在该地区人和猪群中跨物种传播。
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