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摘要
为探究空心泡(Rubus rosaefolius)叶绿体基因组特征，本研究以空心泡为试验材料，采用Illumina NovaSeq平台进行高通量测序，获得空心泡完整的叶绿体基因组序列，并进行空心泡叶绿体基因序列特征和系统发育分析。结果表明：空心泡的完整叶绿体基因组总长度为155 650 bp，具有典型的四分体结构，包括2个反向重复序列(各25 748 bp)、1个大拷贝区(85 443 bp)、1个小拷贝区(18 711 bp)。空心泡叶绿体全基因组共鉴定出131个基因，包括86个蛋白质编码基因、37个tRNA基因和8个rRNA基因，全基因组的GC含量为36.9%。空心泡叶绿体基因组包含47个散在重复序列、72个简单重复序列(simple sequence repeating, SSR)位点，密码子偏好性为亮氨酸密码子，偏好使用A/U结尾的密码子。系统发育分析表明，空心泡与小叶悬钩子(Rubus taiwanicola)亲缘关系最近，其次是能高悬钩子(Rubusrubroangustifolius)和腺萼悬钩子(Rubus glandulosopunctatus)。空心泡的叶绿体基因组特征及其系统发育分析，为空心泡的遗传多样性研究和叶绿体开发利用提供理论依据。
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