摘要
目的 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法构建并分析COVID-19和心房颤动(房颤,AF)的共表达网络,探寻COVID-19相关AF可能发病机制。方法 从GEO数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中获得COVID-19和AF相关数据集,通过WGCNA识别疾病相关模块,将COVID-19和AF疾病相关模块中的基因进行交叉,得到COVID-19相关AF的共享基因,进行GO、KEGG、Reactome、WIKI Pathway分析探寻可能的生物学功能,并构建PPI蛋白网络互作图,运用Cytoscape软件确定关键基因和关键通路。结果 共得到45个COVID-19和AF的共享基因,富集分析显示目标基因涉及多个生物学进程及通路,其中MAPK信号通路最值得关注。结论 探讨了COVID-19和AF之间联系的分子机制,得到了3个关键基因MAP3K1、CREB1、RPS6KA3,认为AngII-MAPK信号通路的过度激活所导致的炎症风暴在COVID-19相关AF中发挥了关键作用。
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单位山西医科大学; 山西医科大学第一医院