明日叶二氢黄酮醇4-还原酶(AkDFR)基因的克隆及生物信息学分析

作者：刘峰; 夏丽芝; 吴立威; 阮盈盈; 王志江^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(06): 1838-1844.

DOI：10.13271/j.mpb.020.001838

• 明日叶(Angelica keiskei)
• 二氢黄酮醇4-原酶(DFR)基因
• 生物信息学分析
• 黄酮类化合物

二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)基因是类黄酮合成途径的关键酶之一,在植物花色形成和黄酮物质合成中起着重要的作用。根据明日叶转录组测序得到的序列设计引物,以明日叶叶片cDNA为模板,通过RT-PCR方法克隆得到明日叶DFR基因的完整序列,并对其进行生物信息学和组织特异性分析。结果表明明日叶的AkDFR基因开放阅读框(ORF)有1 131 bp,编码376个氨基酸,蛋白大小为42.42 kD,等电点为5.83。用DNAman同源序列比对结果表明,明日叶的AkDFR基因与胡萝卜、杜鹃的DFR基因同源性均在80%以上。生物信息学分析AkDFR基因没有信号肽和跨膜区域,亲水系数为负数,可能为亲水蛋白。α-螺旋和无规则卷曲是DFR的主要二级结构元件。AkDFR基因在明日叶的不同组织中均有表达,其中叶片中的表达量最高。明日叶AkDFR基因的克隆及其生物信息学分析将为提高明日叶黄酮类化合物提供理论依据。

• 单位
  宁波城市职业技术学院; 宁波大学; 浙江医药高等专科学校; 温州科技职业学院