秦川牛PLAG1基因启动子克隆及转录因子预测

作者:马勇; 陈宗昌; 李旭鹏; 李静生; 白彦斌; 刘占鑫; 魏亚丽; 郭达山; 石斌刚; 赵志东*; 罗玉柱*; 胡江; 王继卿; 刘秀; 李少斌
来源:中国畜牧兽医, 2023, 50(07): 2661-2669.
DOI:10.16431/j.cnki.1671-7236.2023.07.007

摘要

【目的】探究秦川牛多形性腺瘤基因1(pleomorphic adenoma gene 1,PLAG1)的组织表达规律,并克隆其启动子区序列,预测分析其关键转录因子结合位点,为探究其转录调控机制提供理论参考。【方法】采集3头20月龄秦川牛成年公牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌、瘤胃组织,用实时荧光定量PCR方法检测PLAG1基因在不同组织中的相对表达量,同时克隆PLAG1基因上游启动子区序列,利用生物信息学软件预测PLAG1基因转录起始位点及启动子核心区域,分析、筛选核心启动子区域的关键转录因子结合位点。【结果】PLAG1基因在秦川牛各组织中均有表达,且在背最长肌中的表达量显著高于其他组织(P<0.05)。PLAG1基因启动子序列全长1 861 bp,生物信息学预测分析发现PLAG1基因核心启动子区位于-297―+42 bp,存在高度保守的Krüppel样因子5(KLF5)、cAMP反应元件结合蛋白1(CREB1)和早期生长反应因子1(EGR1)转录因子结合位点,且CpG岛位于PLAG1基因核心启动子区域内。【结论】PLAG1基因在肌肉组织中高表达,其核心启动子区位于-297―+42 bp, KLF5、CREB1和EGR1转录因子对PLAG1基因的转录活性可能具有调控作用。本研究结果为进一步探究PLAG1基因的转录调控机制提供了理论依据。

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