榔梅果实转录组分析及其柠檬酸生物合成途径关键酶基因结构与功能预测

作者：欧金梅; 杨许; 单春苗; 张声祥; 施圆圆; 吴家文; 黄璐琦^*; 王瑞

来源：中国中药杂志, 2020, 45(19): 4606-4616.

DOI：10.19540/j.cnki.cjcmm.20200627.102

• 榔梅
• 转录组
• 基因注释
• 柠檬酸合成途径
• 柠檬酸合酶

榔梅作为孑遗树种,果实极具药用价值。为研究榔梅柠檬酸的生物合成途径,采用Illumina HiSeq XTen高通量测序技术对榔梅果实进行转录组测序,经过拼接组装后得到38 936条unigene,其中28 311条unigene被公共数据库成功注释,15 193条unigene映射到265条KEGG代谢通路;18 908条unigene可归类到59个GO功能亚类。在柠檬酸合成与代谢途径中,共有103条unigene编码15个关键酶参与柠檬酸循环。对柠檬酸合酶进行序列分析和同源建模,结果显示榔梅的柠檬酸合酶是以α螺旋为主的同源二聚体蛋白,酶的活性中心氨基酸高度保守。该研究为榔梅果实中柠檬酸生物合成途径的解析奠定了基础,促进了榔梅基因资源的保护和开发。

• 单位
  中国中医科学院; 安徽中医药大学