PK-15细胞源EDC3分子的克隆及生物信息学分析

作者：孙勇; 李昌红; 袁俊; 刘娟娟; 温贵兰^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2019, (09): 7-179.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2018.06.0316

• mRNA脱帽激活子基因
• 猪肾细胞
• 克隆
• 生物信息学
• 基因序列
• 蛋白质

为了研究猪肾细胞(PK-15)中mRNA脱帽激活因子(EDC3)基因并分析其编码区序列特征,试验采用巢式PCR方法获得PK-15细胞源EDC3基因并进行克隆与测序,利用生物信息学相关在线软件检测PK-15细胞与其他宿主EDC3基因的同源性及构建系统进化树,并对该基因编码蛋白的跨膜结构、信号肽等分子特性进行分析。结果表明:猪EDC3基因全长为1 326 bp,编码440个氨基酸,比预测片段少201 bp;与预测野猪的核苷酸序列同源性达99.0%,氨基酸序列同源性达97.5%;该基因与野猪的亲缘关系最近,处于同一分支,其次是瘤牛、绵羊;EDC3基因编码蛋白的二级结构中无规则卷曲所占比例为59.09%,α-螺旋所占比例为20.68%,该结构蛋白无信号肽与跨膜结构。

• 单位
  动物科学学院; 贵州大学