基于转录组测序的苦瓜热激蛋白相关基因分析

作者：杜文丽; 陈中钐; 许端祥; 徐同伟; 高山^*; 温庆放^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(10): 3141-3149.

DOI：10.13271/j.mpb.018.003141

• 苦瓜(Momordica charantia L.)
• 转录组测序
• 功能注释
• 热激蛋白相关基因

为获得苦瓜叶片高温胁迫状态下表达的相关基因,本研究以高温胁迫下苦瓜叶片为实验材料,采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对正常温度(26℃)和高温胁迫(38℃)下苦瓜叶片转录测序后进行组装,再利用KEGG、Pfam、Swiss-Prot和NR数据库平台对热激蛋白的相关功能基因筛选,共获得24个热激蛋白相关基因,包括得20个热激蛋白基因、2个位于叶绿体中的小热激蛋白以及2个热激转录因子。聚类分析研究表明,涉及到热激蛋白相关的20个Unigene广泛分布于3大类中,其中c42567和c43094这两个亲缘关系最近;两个小热激蛋白c42963和c12133的亲缘关系次之;c35683和c3040两个热激转录因子亲缘关系最远。通过本次研究中获取的24个热激蛋白相关Unigene信息,有助于深入研究苦瓜耐高温胁迫机理等提供数据信息。

• 单位
  福建省农业科学院