水禽细小病毒选择压力与基因重组分析

作者：汪宏才; 商雨; 郭云清; 曾哲; 张蓉蓉; 温国元; 罗青平^*

来源：湖北农业科学, 2023, 62(11): 191-197.

DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2023.11.033

• 水禽细小病毒
• 新型鹅细小病毒
• 分离鉴定
• 选择压力
• 基因重组

通过对临床水禽细小病毒进行PCR检测、基因组测序和进化分析，确定分离毒株的基因型。进一步通过Paml、RDP软件对分离株的基因组进行选择压力和基因重组分析，确定分离株的演化趋势。结果表明，分离的3株水禽细小病毒均属于新型鹅细小病毒，分别命名为YiCH株、AnQ株和XiY株，基因组长度分别为5 056、5 056、5 068 bp。3个分离株与新型鹅细小病毒M15株亲源关系最近，其中XiY株两端ITR区域191～196位、4 878～4 883位均有6个碱基插入。对分离株进行选择压力分析，分离株VP蛋白检测出3个正选择位点，分别为116Q、261A、485S。重组分析显示，分离株YiCH株和AnQ株都存在重组现象，以XiY株为主要亲本株、GPV 06-0329株为次要亲本株重组而成。

• 单位
  湖北省农业科学院畜牧兽医研究所