2021—2022年湖南省PRRSV流行病学调查及基因组特征分析

作者：周宇骏; 龙明英; 孟芳; 王文梅; 邹玖零; 廖淑玲; 杜雅萍; 禹思宇^*

来源：南方农业学报, 2023, 1-11.

• 猪繁殖与呼吸综合征病毒
• 流行病学调查
• ORF5基因
• 病毒分离
• 重组分析
• 湖南

【目的】了解湖南省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行及遗传变异情况，为湖南省PRRS的防控提供科学参考。【方法】2021—2022年从湖南省396个猪场采集1184份疑似PRRSV感染猪的病料样品，采用荧光定量PCR检测PRRSV阳性率，统计不同季节和地区感染情况；利用RT-PCR扩增部分阳性病料样品ORF5基因序列后进行序列同源性和氨基酸序列比对；将部分病料接种Marc-145细胞，通过RT-PCR鉴定；采用Illumina法对PRRSV全基因序测序及分析同源性和遗传进化关系，并对PRRSV基因组重组分析。【结果】共167份样品(14.1%)检测为PRRSV阳性，湖南省不同地区和季节PRRSV样品阳性率分别为0.0%～46.4%和6.95%～19.67%；高致病性PRRSV(HP-PRRSV)、经典型PRRSV和类NADC30株占阳性样品比例分别为43.11%、15.57%和41.32%。共扩增获得21条完整ORF5基因序列(600～603 bp)，同源性分析结果显示，7株与HP-PRRSV参考株GP5氨基酸序列同源性最高(92.1%～98.9%)；13株与类NADC30株同源性最高(91.3%～93.4%)；1株与PRRSV经典株同源性最高(98.6%～99.1%)。氨基酸序列比对结果显示，不同PRRSV GP5氨基酸序列变异程度高，其中2株类NADC30 GP5高变区存在氨基酸缺失，且部分病毒株氨基酸变异区域位于GP5细胞表位区域。共分离获得2株PRRSV(分别命名为HuN-A和HuN-B)，全基因组序列分析结果显示，HuN-A株属于类NADC30株，且该株病毒为以类NADC30株为主要亲本株，以HP-PRRSV株为次要亲本株的重组病毒；而HuN-B株属于类HP-PRRSV株。【结论】湖南省猪群PRSSV流行情况严重，且存在多种基因型，其中类NADC30和HP-PRRSV为主要流行基因型毒株。