盐生草(Halogeton glomeratus)着丝粒反转录转座子及卫星DNA序列的同源克隆与分析

作者：彭亚萍; 陈博; 张燕; 宋美妮; 汪军成; 姚立蓉; 孟亚雄; 马小乐; 李葆春; 王化俊^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(17): 5667-5674.

DOI：10.13271/j.mpb.020.005667

• 盐生草
• 着丝粒
• 反转录转座子
• 同源克隆
• 序列比对

为研究藜科(Chenopodiaceae)植物盐生草(Halogeton glomeratus)着丝粒区域反转录转座子及卫星DNA序列的组成，并探讨盐生草、甜菜(Beta vulgaris L.)、藜麦(Chenopodium quinoa Willd.)这三种藜科植物着丝粒反转录转座子及卫星DNA序列的异同，本研究利用甜菜基因组中发现的着丝粒反转录转座子家族Beetle7中的LTR、Gag、RT等区段和卫星DNA序列pBv分别设计6对特异引物，以盐生草和藜麦基因组DNA为模板，利用同源克隆法获得同源序列并和原序列进行比对。结果显示，在盐生草中获得了LTR、Gag和RT三个区段的同源序列，相似性依次为91%、92%和95%，藜麦中仅存在RT同源序列，相似性为96%；仅在盐生草中获得了卫星DNA序列pBv，同源序列相似性为93%，藜麦中未获得该同源序列。由此可见，Beetle7中的LTR、Gag和RT序列存在于盐生草中，而藜麦中不存在，卫星DNA序列pBv也仅存在于盐生草中，更进一步说明藜科植物盐生草和甜菜的亲缘关系更近。

• 单位
  甘肃农业大学; 生命科学技术学院