苏姜猪线粒体DNA D-Loop区遗传多样性及系统进化研究

作者：陶勇; 任善茂; 董晓君; 赵旭庭^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2023, (22): 51-56.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2022.09.0187

• 苏姜猪
• mtDNA D-Loop区
• 序列分析
• 单倍型
• 遗传多样性
• 系统进化

为了研究苏姜猪的遗传多样性和系统地位，试验采集47头苏姜猪的耳组织进行基因组DNA提取，利用PCR技术扩增线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA) D-Loop区序列并测序，对47条苏姜猪mtDNA D-Loop区序列的碱基组成和含量、序列长度、变异位点、单倍型数量及单倍型多样性和核苷酸多态性指标进行了分析，估计序列变异程度，并构建系统发育树和分析单倍型网络关系，最后利用其他24个猪种的mtDNA D-Loop区序列构建了苏姜猪mtDNA D-Loop区序列系统发育树。结果表明：苏姜猪mtDNA D-Loop区全长序列为1 194～1 274 bp, A、T、C、G碱基含量分别为32.9%、24.8%、26.5%、15.8%;47条序列共鉴定出3种单倍型和8个变异位点(均为简约性信息位点);单倍型多样度为0.001 73,核苷酸多样度为0.499,平均核酸差异数为1.210,Tajima’s D值为-0.916 74(P>0.10),符合中性突变；该苏姜猪群有3个分支，推测有3个母系起源，并与长江流域以南猪种有较近的亲缘关系。说明苏姜猪群体遗传多样性较为丰富，具有3个母系来源。

• 单位
  江苏农牧科技职业学院