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摘要
为挖掘甜瓜抗枯萎病相关基因，本研究以高抗枯萎病自交系YN为母本，高感枯萎病自交系CG为父本构建F2群体，基于F2群体分别构建极端高抗混池和高感混池，对子代混池和双亲池开展30X覆盖深度的全基因组重测序，通过计算2个子代池的SNP-index，比较SNP-index在高抗池与高感池染色体各区段的差异，定位与抗病性的关联区域，根据基因注释信息，预测候选基因。结果表明4个样本获得的SNP位点和Indel分别在91万～250万个之间和17万～45万个之间。基于SNP-index关联分析，在99%的置信区间内将候选区域定位到甜瓜染色体Chr.09的1个区间，总长度为1.37 Mb，位于1～1 370 000 bp区间，包含197个基因，SNP-indel位点数7 442个。通过对候选区域内的基因进行KEGG、GO数据库分析发现，候选基因分别被注释到18个生物学进程、9个细胞组分和6个分子功能中；主要参与氨基酸生物合成、氨基酸代谢、酯类代谢、糖类代谢等，经分析在候选区域内与抗病性相关的基因共有22个，3个与F-box基因相关，3个水解蛋白相关基因，4个乙烯反应转录因子，1个泛素蛋白连接酶，2个GDSL酯酶等。本研究结果将为甜瓜枯萎病的抗病分子机理提供新思路，同时为其抗病性功能性分子标记的开发及相关基因的克隆提供参考。
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