肾纤维大鼠circRNA调控网络构建及靶基因预测

作者:朱芸; 杨芳; 胡瑚; 谭琳燕; 梁作辉*
来源:中国临床药理学杂志, 2023, 39(03): 373-376.
DOI:10.13699/j.cnki.1001-6821.2023.03.016

摘要

目的 构建肾纤维化大鼠体内circRNA-miRNA-mRNA调控网络,预测肾纤维化潜在的治疗靶点。方法 构建肾纤维大鼠模型,通过全转录组测序及生物信息学分析,筛选显著差异表达的circRNA,并构建其ceRNA调控网络。结果 筛选出17种同时存在于肾纤维化大鼠及老年大鼠中的circRNA,功能富集分析表明这些circRNA的来源基因主要参与FoxO信号通路、黏着斑、内吞作用等。此外,通过构建ceRNA网络发现,这些circRNA还可能通过调控泛素化相关基因参与肾纤维化的发生发展。结论 成功构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络,并筛选出10种参与泛素化修饰的基因,这些基因均可能成为肾纤维化的潜在治疗靶点。

  • 单位
    昆明医科大学第六附属医院

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