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摘要
目的构建骨碎补活性成分-作用靶点网络和蛋白相互作用网络,分析靶点涉及的生物过程和通路,研究骨碎补抗骨质疏松(osteoporosis,OP)的潜在机制。方法通过TCMSP数据库筛选骨碎补的活性成分,用Swiss数据库预测其靶点,与Disgenet数据库获得的OP靶点相映射,得到骨碎补抗OP的潜在靶点。利用Cytoscape构建"骨碎补-活性化合物-潜在靶点"网络,采用String数据库和Cytoscape构建蛋白相互作用网。利用David数据库进行GO生物功能和KEGG通路富集分析。结果得到骨碎补活性成分18个,其治疗OP的潜在靶点24个。成分豆甾醇(stigmasterol)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、黄烷酮(Eriodyctiol (flavanone))、山奈酚(kaempferol)、柚皮素(naringenin)、圣草酚(eriodictyol)和环木菠萝烷醇(cycloartenone)能与5个以上靶点相连,为骨碎补抗OP的主要成分。靶点CYP19A1与成分连接次数为8次,对骨碎补抗OP具有重要意义;CYP1B1为4次,MMP1、CA2、CYP17A1、ESR1、MMP13、LDLR、CYP1A1、MMP2均为3次,对骨碎补抗OP有较大意义。GO生物过程和KEGG富集分析显示,骨碎补抗OP主要涉及氧化还原过程(oxidation-reduction process)、基因表达正调控(positive regulation of gene expression)、类固醇代谢) steroid metabolic process)、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录起始(transcription initiation from RNA polymerase II promoter)等生物学过程,通过调节代谢通路(Metabolic pathways)、类固醇激素生物合成(Steroid hormone biosynthesis)、卵巢类固醇生成(Ovarian steroidogenesis)、癌症通路(Pathways in cancer)等通路发挥抗OP作用。结论本研究体现骨碎补多成分、多靶点、多途径的作用特点,为阐释其治疗OP的作用机制提供了科学依据,为进一步开展骨碎补抗OP分子作用机制的研究以及新药开发等提供了新思路和新方法。
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