矿床成因是地质工作者对不同时代、不同地区的同类型矿床进行比较，总结出的地层、构造及围岩蚀变等一系列有利于矿床形成的地质条件。祁连山是重要成矿带，上白土湾子铁矿位于肃南裕固族自治县（简称肃南县），地处祁连山中西部，产出于长城系（Ch）含铁千枚状板岩中，属沉积变质型铁矿，同时受特定构造（西北向韧脆性断裂）的控制，属双重控制性矿床。
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