昆明裂腹鱼FGF基因的测序验证与进化分析

作者：王小会; 苗贵东^*; 彭紫威; 龙晓武; 王封瑞; 刘显威

来源：科技创新与生产力, 2023, 44(11): 108-114.

• 昆明裂腹鱼
• FGF基因
• 测序
• 进化分析

利用第三代测序得到全长转录组文库的FGF基因序列进行引物设计，PCR产物直接测序验证基因序列，获得FGF基因全长为787 bp。FGF基因的ORF长度为699 bp，共编码232个氨基酸。核苷酸序列同源性比对结果发现与鲤鱼FGF13基因同源性为99.50%，与金线鲃、鲤鱼、鲫鱼、斑马鱼对应的FGF基因的同源性较高、亲缘关系较近；进一步与FGF基因各亚型氨基酸序列比对发现，与FGF13a-2基因的氨基酸序列的同源性为99.01%，判断该基因为昆明裂腹鱼FGF13a-2基因。结构域预测发现有受体结合位点和肝素结合位点，FGF基因编码蛋白的二级结构中α-螺旋占比为22.41%、β-转角占比为8.19%、延伸链占比为21.55%、无规卷曲占比为47.84%，具备FGF蛋白转录因子超家族特征。

• 单位
  兴义民族师范学院