苎麻BnMAN1基因及其启动子的克隆分析

作者：马玉申; 刘泽航; 揭雨成; 邢虎成

来源：分子植物育种, 2018, 16(13): 4202-4210.

DOI：10.13271/j.mpb.016.004202

• 苎麻
• β-甘露聚糖酶
• BnMAN1
• 启动子
• 生物信息学分析

甘露聚糖酶基因在植物种子萌发、果实的成熟软化、植物器官的脱落以及非生物胁迫等过程发挥重要作用。为研究其在苎麻中的基因功能,本研究根据苎麻转录组测序中的Bn MAN1片段序列,克隆该基因的c DNA全长及其上游的调控序列。生物信息学分析发现:Bn MAN1基因上游的调控序列包括TATA-box、CAAT-box、AE-box、Box 4、I-box、GAG-motif、GATA-motif、Skn-1motif、ARE、Aux RR-core、TCA-element、MBS等顺式作用元件。Bn MAN1基因开放阅读框为1 128 bp,编码375个氨基酸,预测其相对分子质量为42.47 k D,理论等电点为9.45。与桃树(ABV32548)、苦瓜(XP022132624)、毛果杨(XP006383170)、野生大豆(KHN36084)和橡胶树(XP021678603)氨基酸序列相似性分别为82%、81%、79%、79%、76%。蛋白的二级结构中α-螺旋约占45.33%,延伸链约为15.20%,无规则卷曲约为39.47%。结构域分析发现具有COG3934、Cellulase结构域,属于β-甘露聚糖酶类。苎麻Bn MAN1及其启动子将为今后对该基因在苎麻中的功能研究提供帮助。

• 单位
  湖南农业大学