微生境下小叶章基因组基于毛细管电泳的MSAP分析

作者：张玉; 冷海楠; 王继丰; **怡^*; 倪红伟; 杨轶华

来源：分子植物育种, 2022, 20(24): 8179-8185.

DOI：10.13271/j.mpb.020.008179

• 小叶章
• 甲基化敏感扩增多态性
• DNA甲基化
• 表观遗传

本研究旨在对3种不同生境下小叶章(Deyeuxia angustifolia)的基因组DNA进行甲基化分析。应用荧光标记甲基化敏感扩增多态性(F-MSAP)方法分析3种生境下共计57个小叶章样本的DNA甲基化程度。结果表明57份小叶章样品，采用筛选出的8对MSAP引物共扩增到1 417个位点，以Ⅳ甲基化模式为主，平均全甲基化率或位点缺失率为36.27%，Ⅱ型和Ⅲ型甲基化模式最少，平均半甲基化率和内侧甲基化率分别为17.63%、18.59%;3种生境下MSAP位点信息的Shannon多态性指数最高的是典型草甸(I=0.568 7)，最低的是沼泽化草甸(I=0.557 8)；在表观遗传上，典型草甸和沼泽化草甸的材料能相对的各自聚类到一组，而沼泽小叶章的材料与典型草甸和沼泽化草甸有一定交集。本研究通过F-MSAP技术对小叶章不同生境甲基化表观遗传多样性进行研究，为小叶章适应环境的表观遗传机制研究提供基础数据。

• 单位
  黑龙江省林业科学院; 黑龙江省科学院自然与生态研究所