探究CUL4B在结直肠癌患者来源的肿瘤类器官中调控miRNAs

作者:李彦军; 王宇星; 穆雅琴; 鲍欣雨; 刘杨青; 何耀麒; 肖冰帅; 杨嘉凯; 张年萍*; 郝大江*
来源:山西大同大学学报(自然科学版), 2023, 39(02): 67-72.

摘要

目的 探究CUL4B在肿瘤患者来源的结直肠癌肿瘤类器官中调控miRNAs。方法 利用干扰CUL4B的和其对照的PDOs样本,进行miRNA-seq,对差异miRNAs的靶基因进行KEGG和GO等分析。利用TargetScan和miRDB 2个数据库分别预测可能受CUL4B调控的并且评分≥85分的miRNAs,结合miRNA-seq差异miRNAs进行韦恩分析。结果 miRNA-seq结果显示共有41个差异miRNAs。TargetScan和miRDB两个数据库和测序数据韦恩分析发现miR495-3p、miR381-3p和miR148b-5p 3个共同交集的miRNAs。KEGG结果显示代谢通路富集的基因个数最多,溶酶体富集基因Q值最小。GO分析结果显示单有机体过程、蛋白质结合和细胞质富集基因最多。流式细胞仪检测发现干扰CUL4B的表达并不影响PDOs的细胞周期。结论 CUL4B可能是通过代谢通路和溶酶体2个信号通路调控miR495-3p、miR381-3p和miR148b-5p。

  • 单位
    山西大同大学; 山东大学; 大同市第三人民医院; 基础医学院