基于网络药理学和生物信息学筛选小青龙汤治疗支气管哮喘的关键基因和通路

作者：臧凝子; 李品; 庞立健; 吕晓东^*

来源：中国实验方剂学杂志, 2021, 27(03): 171-183.

DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.20202313

• 小青龙汤
• 网络药理学
• 生物信息学
• 基因
• 信号通路

目的:运用网络药理学与生物信息学方法构建"疾病-基因-靶点-成分-药物"网络以探索小青龙汤治疗支气管哮喘的关键基因和信号通路。方法:基于高通量基因表达(GEO)数据库筛选哮喘与健康人差异基因,通过TCMSP数据库检索小青龙汤中药物活性成分,筛选疾病基因和药物成分靶点作为交集基因,采用R语言,Cytoscape 3.7.2软件中不同软件包分别对交集基因进行蛋白互作(PPI)分析,基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:GEO数据库中编号为Series GSE43696符合研究要求,内含108张芯片数据,通过筛选得到差异表达基因820个;小青龙汤中共含有活性成分169个,对应作用靶点246个;通过小青龙汤靶基因与疾病基因取交集共获得25个交集基因;PPI网络结果提示91个靶点可能参与小青龙汤作用机制中;GO富集分析共涉及包括氧化应激、炎症反应、细胞外基质调控、血管内皮生长因子功能调控在内的180条基因功能;KEGG富集分析共获得包括辅助性T细胞17(Th17)分化调控,白细胞介素-17(IL-17),肿瘤坏死因子(TNF),低氧诱导因子-1α(HIF-1α)在内的39条信号通路。结论:小青龙汤在哮喘干预中体现了多成分、多靶点、多通路特征,该研究结果可为小青龙汤机制挖掘提供重要依据。

• 单位
  辽宁中医药大学; 辽宁中医药大学附属医院