miR－449a：WNT亚型髓母细胞瘤潜在的表观遗传学标志物

作者：李永笑; 邵立伟; 姜涛; 刘岩; 常青

来源：中华病理学杂志, 2017, 46(10): 684-689.

DOI：10.3760/cma.j.issn.0529-5807.2017.10.005

• 髓母细胞瘤
• 分子分型
• 微RNAs
• DNA甲基化

目的筛选可能受甲基化调控的, 与髓母细胞瘤(medulloblastoma, MB)WNT分子亚型相关的微小RNA(miRNA)分子标志物。方法采用NanoString技术对45例原发性MB石蜡样本进行了包含22个经典MB亚型特异性基因的mRNA表达水平的检测, 从而对肿瘤进行分子亚型鉴定。同时通过miRNA表达芯片检测去甲基化药物处理前后MB细胞系(Daoy、D283、D341)的miRNA表达情况, 筛选出可能受甲基化调控的miRNA分子标志物, 并用甲基化特异性PCR(MSP)和即时荧光定量PCR方法对其甲基化状态和表达水平分别进行验证。最后, 对照分子亚型找到与MB亚型相关的受甲基化调控的miRNA。结果 45例MB除1例无法准确划分亚型外, 其余44例中4例为WNT组, 8例为SHH组, 16例为Group3, 16例为Group4。miR-449a在去甲基化药物处理前后的MB细胞系中表达水平具有明显差异, 生物信息学分析确认了其启动子区CpG岛的存在, MSP方法进一步证明了部分肿瘤受启动子高甲基化的调控, 且WNT亚型MB肿瘤样本中发现miR-449a存在相对高表达。结论基于金标准(NanoString技术)对MB肿瘤进行分子亚型鉴定, 并发现miR-449a在MB细胞系中受到甲基化调控, 其可能为WNT亚型MB的分子标志物。

• 单位
  解放军总医院; 北京大学第三医院; 北京天坛医院; 基础医学院; 北京市神经外科研究所; 山东省临沂市人民医院