细粒棘球蚴AgB1、AgB2、AgB4抗原表位的特性分析

作者：安梦婷; 吾拉木·马木提; 马海梅; 张峰波; 王红英; 赵慧; 丁剑冰

来源：新疆医科大学学报, 2016, 39(12): 1541-1553.

• 细粒棘球蚴
• AgB
• 生物信息技术
• B细胞表位

目的分析新疆细粒棘球蚴AgB1、AgB2、AgB4蛋白的氨基酸序列,了解其蛋白二级结构特点,预测抗原表位,为包虫病的进一步免疫学诊断和研究提供理论支持。方法利用生物信息分析软件DNAstar分析3种抗原的蛋白二级结构特点,运用在线软件IEDB对3种抗原各参数进行综合分析并预测其抗原表位。结果EgAgB1、EgAgB2和EgAgB4分别是由78、90、91个氨基酸残基组成的不同多肽。其蛋白质二级结构中均有α-螺旋、β-折叠、转角区域和卷曲区域。综合分析各参数推测EgAgB1具有2个抗原表位,分别是1423位氨基酸残基(DDGLTSTSRS)、3742位氨基酸残基(RDPLGQ)。推测EgAgB2的2个抗原表位分别为4149位氨基酸残基(DFFRNDPLG)、8390位氨基酸残基(EEKDDDSk)。EgAgB4可能含有的2个抗原表位分别是4350位氨基酸残基(RSDPLGQR)、8489位氨基酸残基(EEEDDS)。结论采用生物信息技术对新疆细粒棘球蚴AgB1、AgB2、AgB4进行B细胞表位特点的研究和分析,对更准确诊断包虫病具有重要意义。

• 单位
  基础医学院; 新疆医科大学第一附属医院; 新疆医科大学