紫朱软膏干预下肢静脉性溃疡的LncRNA表达差异研究

作者:杨晓; 何一波; 卢慧敏; 杜玉青; 黄仁燕; 王宏飞; 闫少庆; 李文惠; 柳国斌*
来源:中华中医药杂志, 2023, 38(05): 2067-2072.

摘要

目的:通过高通量测序及生物信息学分析方法寻找紫朱软膏干预下肢静脉性溃疡的可能机制。方法:紫朱软膏治疗下肢静脉性溃疡大白兔模型3只,应用二代测序技术寻找用药前后差异LncRNA,利用生物信息学分析方法分析差异LncRNA,初步建立下肢静脉性溃疡差异表达LncRNA与靶基因及基因功能调控网络。结果:紫朱软膏外用新西兰大白兔下肢静脉性溃疡疮面中存在176个有差异表达的LncRNA,其中上调有91个,下调有85个,确定了10个差异表达的LncRNA。mRNAs有1 801个,上调、下调的mRNAs分别有751、1 050个;GO分析结果表明,差异表达的LncRNA分别富集在生物学过程(BP)、细胞成分(CC)、分子功能(MF)。KEGG富集分析结果表明,差异表达的LncRNA主要富集在与细胞周期、肿瘤相关的通路和信号转导通路上。结论:初步建立下肢静脉性溃疡差异表达LncRNA与靶基因及基因功能调控网络。

  • 单位
    上海中医药大学附属曙光医院