基于核酸DNA/RNA同位素示踪技术的水稻土甲烷氧化微生物研究

作者：郑燕; 贾仲君

来源：土壤学报, 2016, (02): 490-501.

• 水稻土
• 好氧甲烷氧化
• 稳定性同位素示踪DNA/RNA Paddy soils
• Aerobic methane oxidation
• DNA/RNA-Stable Isotope Probing

稳定性同位素示踪复杂土壤中微生物DNA/RNA的技术难点是13C-DNA/RNA的鉴定。本研究针对我国六种典型水稻土,利用稳定性同位素13CH4示踪活性的甲烷氧化菌,超高速密度梯度离心获得不同浮力密度DNA/RNA后,以甲烷氧化菌独有的pmo A功能基因和16S r RNA特异基因作为分子标靶,通过半定量凝胶电泳技术评价了特异基因作为分子标靶判定13C-DNA/RNA的可行性,进一步利用克隆文库技术研究水稻土中的活性甲烷氧化菌群落结构。结果表明:甲烷氧化菌功能基因pmo A作为分子标靶,能够准确鉴别13C-DNA,而甲烷氧化菌特异的16S r RNA基因则能较好地区分12C和13C标记的RNA...

• 单位
  食品与生物工程学院; 中国科学院南京土壤研究所; 郑州轻工业学院; 土壤与农业可持续发展国家重点实验室