利用TCGA和GEO公共数据集分析GSR在胃癌中的表达及其临床意义

作者：兰庆芝; 王琪; 马静静; 董卫国

来源：中国医师杂志, 2017, 19(07): 1014-1017.

• 染色体图
• 肿瘤/遗传学
• 基因表达谱
• 谷胱甘肽还原酶/代谢
• 胃肿瘤/代谢

目的通过癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据集和基因表达汇编(GEO)数据库探索谷胱甘肽还原酶(GSR)在胃癌中的表达情况,研究GSR与胃癌临床病理特征的联系,分析GSR与其他生物通路的关系,推测GSR对评价胃癌患者预后的意义,探讨GSR在胃癌发生发展过程中的作用。方法检索TCGA中的胃癌数据集并下载,结合临床信息对芯片数据进行分析。对肿瘤样本进行基因富集分析从而发现与GSR相关的生物学通路。结果 GSR在不同美国肿瘤研究联合委员会(AJCC)T分期中的表达水平差异有统计学意义(P<0.01)。在不同年龄、性别、肿瘤最短径、AJCC M分期、有无Barrett食管、有无胃癌家族史、有无幽门螺杆菌(HP)感染中的表达量则差异无统计学意义(P>0.05)。GSR高表达患者的无病生存期及总生存期均比GSR低表达患者更长(P<0.05)。GSR高表达的肿瘤样本富集了与氧化磷酸化、核苷酸代谢、蛋白进入线粒体过程、有丝分裂周期调控等生物学通路的基因。结论 GSR可以作为潜在的判断胃癌患者预后的指标及治疗胃癌的靶点。

• 单位
  青岛大学附属医院; 武汉大学人民医院